Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFAP99D6REC4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms