Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms