Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U3KPZ7 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 SLC14A1-203ENST00000415427 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AP001885.1-202ENST00000444002 1255 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 ASPA-202ENST00000456349 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC110800.1-201ENST00000505498 441 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TMEM161B-207ENST00000509387 963 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 LINC01591-202ENST00000522279 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 LINC00852-201ENST00000475197 1328 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
U3KPZ7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms