Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
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