Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms