Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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