Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFIP11Q9UBB9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms