Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms