Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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VAPAQ9P0L0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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