Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PFDN4Q9NQP4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PFDN4Q9NQP4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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PFDN4Q9NQP4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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PFDN4Q9NQP4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN4Q9NQP4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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