Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TIMMDC1Q9NPL8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TIMMDC1Q9NPL8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TIMMDC1Q9NPL8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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