Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms