Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms