Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC8Q9BY41 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC8Q9BY41 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HDAC8Q9BY41 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC8Q9BY41 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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