Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SNHG12Q9BXW3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms