Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms