Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms