Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms