Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3GL3Q99963 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms