Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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