Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG3Q96JB2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms