Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPBP1Q92547 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms