Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms