Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRIM48Q8IWZ4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM48Q8IWZ4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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