Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTF1AQ7RTS3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms