Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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