Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPANXN3Q5MJ09 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms