Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB6CQ53S08 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB6CQ53S08 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB6CQ53S08 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB6CQ53S08 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB6CQ53S08 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB6CQ53S08 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB6CQ53S08 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB6CQ53S08 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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