Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PMS2-201ENST00000265849 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RCAN1-202ENST00000381132 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AL022476.1-201ENST00000443063 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 KIRREL1-201ENST00000359209 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms