Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms