Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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