Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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