Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms