Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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