Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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