Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 522.2 ms