Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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