Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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