Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms