Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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