Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms