Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms