Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AP003072.3-201ENST00000623456 594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC100803.1-201ENST00000501440 1380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDAP1Q13442 TMEM161B-207ENST00000509387 963 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms