Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IKZF1Q13422 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms