Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PMS2P3Q13401 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PMS2P3Q13401 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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