Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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