Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms