Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC15Q0P6D6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms