Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms