Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms